怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/04/29 05:27:54

怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点
怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点

怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点
一般要通过实验验证.
常用的方法有：凝胶阻滞实验,DNaseI足迹实验,甲基化干扰试验.

知道了序列，首先可以通过软件来预测。这样的软件有很多，比如
http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3
得到大致的位置后，可以在通过各种实验手段来证实。比如ChIP， gel shift 等

一般需要做序列分析先，如果你的DNA是已知的，可以直接上公共数据库，比如NCBI, Ensembl, uniprot等数据库看看是不是已经有已知信息可以用了：比如 'DNA binding site: 123, 456....'
如果没有，就需要自己做序列分析了，可以用一些通用软件，也可以自己做些特定的分析。...

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一般需要做序列分析先，如果你的DNA是已知的，可以直接上公共数据库，比如NCBI, Ensembl, uniprot等数据库看看是不是已经有已知信息可以用了：比如 'DNA binding site: 123, 456....'
如果没有，就需要自己做序列分析了，可以用一些通用软件，也可以自己做些特定的分析。

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