我想得到小鼠mm9的全基因组的fa格式序列,现在手里有单个染色体的fa格式的序列,用什么工具整合这些数据

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/07 06:28:19

我想得到小鼠mm9的全基因组的fa格式序列,现在手里有单个染色体的fa格式的序列,用什么工具整合这些数据
我想得到小鼠mm9的全基因组的fa格式序列,现在手里有单个染色体的fa格式的序列,用什么工具整合这些数据

我想得到小鼠mm9的全基因组的fa格式序列,现在手里有单个染色体的fa格式的序列,用什么工具整合这些数据
windows下面的话任何能处理大型文本文件的编辑器都可以的,例如LTFviewer
linux下直接cat file1 file2 > file3 就可以合并文件了.

如果没猜错,因该是用比较省的非可见字符存储的文件。这种文件用可是文件打开是乱码。
你为什么要整合,本来基因就是一个一个的说。我手里倒是有一个.2bit的文件是全基因组的序列,不过要转译成fasta还需要装软件太麻烦。我要整合的不是基因,而是染色体,我手里有9个fasta格式的文件对应九条染色体,我还有一些RNA的数据,要map到DNA上看表达量作分析,RNA数据是全基因范围内的转录本 对应...

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如果没猜错,因该是用比较省的非可见字符存储的文件。这种文件用可是文件打开是乱码。
你为什么要整合,本来基因就是一个一个的说。

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