作业帮请问如何分析一个基因中的回文结构?
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/06 01:30:15
请问如何分析一个基因中的回文结构?
请问如何分析一个基因中的回文结构?
请问如何分析一个基因中的回文结构?
盼各位大牛提供点思路!谢谢了!回文结构序列是指顺读和反读都一样的序列,广泛存在于各种生物体基因组中.它可以在质粒、病毒和细菌基因组DNA以及真核染色体和细胞器中找到,并且广泛分布于人类癌细胞中.很多蛋白质的结合位点是回文结构：转录因子的结合位点,还有终止子也通常是回文结构.编码小RNA和其它非翻译RNA的基因很多片段也是回文结构.很多功能位点都是回文结构.
有几篇文献供参考.
Computational Methods in Science and Technology 5, 21-24 (1999)SEARCHING FOR PALINDROMIC SEQUENCES IN PRIMARY STRUCTURE OF PROTEINS
Palindrome Patterns in Genomes Arthur Chun-Chieh Shih, D. T. Lee , Chi-Fang Chin, Hong-Yuan Mark Liao, and Wen-Hsiung Li
bioinformatics 2000 vol 16 no 11 page 968-977
BBRC 316 (2004) 755–762 The relationship between palindrome avoidance and intragenic codon usage variations: a Monte Carlo study Anders Fuglsang
BBRC 310 (2003) 280–285 Distribution of potential type II restriction sites
(palindromes) in prokaryotes Anders Fuglsang
Theoretical comupter science 292 (2003) 9-31
Pattern Recognition 35 (2002) 2581–2591 Finding approximate palindromes in strings
你讲的是DNA或者RNA的.蛋白质的回文序列有没?谢了.
qigai wrote:回文结构序列是指顺读和反读都一样的序列,广泛存在于各种生物体基因组中.它可以在质粒、病毒和细菌基因组DNA以及真核染色体和细胞器中找到,并且广泛分布于人类癌细胞中.很多蛋白质的结合位点是回文结构：转录因子的结合位点,还有终止子也通常是回文结构.编码小RNA和其它非翻译RNA的基因很多片段也是回文结构.很多功能位点都是回文结构.
有几篇文献供参考.