深度测序的read是什么 mapping到基因组是RNA还是DNA基因组.是否所有的深度测序都要RNA先反转录成cDNA

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/27 17:23:35

深度测序的read是什么 mapping到基因组是RNA还是DNA基因组.是否所有的深度测序都要RNA先反转录成cDNA
深度测序的read是什么 mapping到基因组是RNA还是DNA基因组.是否所有的深度测序都要RNA先反转录成cDNA

深度测序的read是什么 mapping到基因组是RNA还是DNA基因组.是否所有的深度测序都要RNA先反转录成cDNA
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将DNA打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads.
至于是mapping到基因组还是DNA基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组.并不是所有测序都要RNA反转,这其实要看你想做什么分析,如做转录组、表达谱分析就只需RNA样品,而做全基因组重测序当然就要DNA了.

read就是一个个的转录本,mapping到基因组,是到DNA基因组。这样就可以判断哪些基因被转录了?转录的水平如何? 你做的材料首先要已经被测序才能被mapping到DNA基因组。对于还没有被测序的物种,可以首先拿已经测序的近亲物种作为参考基因组,也可以得到转录本的详细GO信息。希望对你有所帮助!...

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read就是一个个的转录本,mapping到基因组,是到DNA基因组。这样就可以判断哪些基因被转录了?转录的水平如何? 你做的材料首先要已经被测序才能被mapping到DNA基因组。对于还没有被测序的物种,可以首先拿已经测序的近亲物种作为参考基因组,也可以得到转录本的详细GO信息。希望对你有所帮助!

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只的是高通量测序吧,相当于有多少条DNA被读了,被测了得意思。只有把RNA构建成cDNA文库才能测序。