如何用宏基因组测序?
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/09/21 09:31:19
如何用宏基因组测序?
如何用宏基因组测序?
如何用宏基因组测序?
宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和.它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的.宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成为微生物研究的最前沿领域
对环境样本进行DNA提取后进行16S或18S等区域扩增,再对扩增产物进行建库、测序,然后对所得的数据进行生物信息学分析.生物信息分析主要包括OTU的生成及rank-abundance分析、取样充足性分析、丰度和多样性分析、菌群间差异分析、假设验证分析、进化树分析等.
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