您好~PCR产物,AT含量很高,双向测序的效果都很差,大约过了100bp就是杂峰了,我该如何做?我一般都是PCR产物直接送测,这回试过纯化后送测,效果没有改善.因为我这个片段比较长,3.2kb,需要转化挑

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/28 17:12:02

您好~PCR产物,AT含量很高,双向测序的效果都很差,大约过了100bp就是杂峰了,我该如何做?我一般都是PCR产物直接送测,这回试过纯化后送测,效果没有改善.因为我这个片段比较长,3.2kb,需要转化挑
您好~PCR产物,AT含量很高,双向测序的效果都很差,大约过了100bp就是杂峰了,我该如何做?
我一般都是PCR产物直接送测,这回试过纯化后送测,效果没有改善.因为我这个片段比较长,3.2kb,需要转化挑克隆送测吗?效果能得到改善吗?

您好~PCR产物,AT含量很高,双向测序的效果都很差,大约过了100bp就是杂峰了,我该如何做?我一般都是PCR产物直接送测,这回试过纯化后送测,效果没有改善.因为我这个片段比较长,3.2kb,需要转化挑
你的序列AT含量很高,测序结果不好,所以我怀疑是你的片段里有polyA或者是polyT,一般超过7个以上的都会引起后续的测序乱峰,你的乱峰前边如果是一连串的A或者T的话,那就是这个原因,想要测好得靠运气,即使是克隆也无法避免,你的片段这么长,仅用两个引物是肯定测不全的,必须还要再额外设计测序引物.如果没有poly结构则也可能是片段重复,这也会导致乱峰或移峰,现象和poly结构一样.如果这两种情况都没有,那就是你PCR做得不好,非特异太多且大小相近,需要改善条件或者重设引物.